中国中医科学院中药资源中心于2012年12月18日经国家中医药管理局批准成立，前身为中国中医科学院中药研究所生药室，建立于1955年12月19日。

中心以中药资源学科优势为基础，整合国内研究力量，全面承接全国中药资源普查成果。以道地药材品质保障与资源持续利用全国重点实验室建设为抓手，服务中药资源持续利用国家战略需求。聚焦中医药重大科学问题研究，兼顾中药科技成果转化，基础研究与应用研究并重，成为引领我国中药资源研究、学科发展、人才培养的国家级平台。

中心是道地药材品质保障与资源持续利用全国重点实验室建设单位之一。有国家中医药管理局4个高水平重点学科，道地药材生态遗传、中药资源遥感监测与区划2个重点研究室和中药资源生态、生药分子鉴定2个三级实验室，“一带一路”药用植物资源开发与利用基地。有科技部重点领域“中药资源创新团队”“中药生态农业创新团队”，农业农村部中药材生物学与栽培重点实验室，国家文物局中医药文物研究国家文物局重点科研基地，北京市道地中药功能基因组重点实验室。是中华中医药学会中药鉴定专业委员会、中国中药协会中药生态农业专业会委员会等11个专业委员会和ISO/TC249/WG1的挂靠单位。

中心优势研究领域为中药资源普查和监测、道地药材形成机理研究、分子生药及合成生物学研究、中药生态农业研究、中药标准化研究、本草考古研究。中心先后获国家科技进步二等奖6项，省部级一、二等奖40余项。获全国专业技术人才先进集体、全国三八红旗集体、中国生态文明奖先进集体等荣誉称号。